Laboratoire des pathogènes et de l'immunité de l'hôte

Mini-bio - Laure Yatime

YATIME LAURE

POSITION

Chercheur INSERM (CRCN), PhD, HDR

Équipe "Immunité, inflammation et virulence bactérienne". 

Groupe "Signaux de danger et inflammation chronique

CONTACT

E-mail : laure.yatime[at]inserm.fr

Téléphone : +33 (0)4 67 14 92 03 +33 (0)4 67 14 92 03 

BIOGRAPHIE

Laure Yatime a une formation d'ingénieur chimiste (Chimie ParisTech). Attirée très tôt par les sciences à l'interface entre la chimie et la biologie, elle a rejoint le Laboratoire de biochimie de l'Ecole Polytechnique pour y effectuer sa thèse de doctorat sur l'initiation de la traduction chez les Eukarya et les Archaea. Après avoir obtenu son diplôme en 2005, Mme Yatime a rejoint le groupe du professeur Poul Nissen à l'université d'Aarhus, au Danemark, en tant que chercheuse postdoctorale. Ses travaux ont abouti à la caractérisation structurelle du mode de reconnaissance des stéroïdes cardiotoniques par la pompe sodium-potassium, ouvrant ainsi la voie au développement de composés cardiotoniques plus efficaces et moins toxiques à l'avenir. En 2010, elle a été nommée conseillère principale dans le groupe du professeur Gregers Rom Andersen à l'université d'Aarhus pour développer des approches basées sur la structure afin de cibler sélectivement le système du complément dans un contexte inflammatoire. Depuis 2010, les recherches du Dr. Yatime se concentrent sur des récepteurs spécifiques du système immunitaire inné et leur implication dans les processus inflammatoires par la reconnaissance de motifs moléculaires associés à des dommages. En 2013, elle a commencé un projet de recherche indépendant à l'Université d'Aarhus sur les récepteurs des protéines S100 impliqués dans l'inflammation pendant le cancer. Elle est revenue en France en 2016 où elle a obtenu un poste permanent de chercheur Inserm CRCN à l'Université de Montpellier. Elle co-dirige actuellement l'équipe "Immunité, Inflammation & Virulence Bactérienne", avec le Dr Georges Lutfalla et le Dr Mai Nguyen-Chi, au sein du Laboratoire des Pathogènes et de l'Immunité de l'Hôte (LPHI). Au sein de l'équipe, elle dirige le groupe "Signaux de danger et inflammation chronique" qui vise à étudier la biologie des alarmines S100 dans la santé et la maladie ainsi que les mécanismes de virulence d'Escherichia coli invasif adhérent dans la maladie de Crohn, en utilisant des approches multi-échelles allant de la biologie structurale et de la biochimie à la modélisation in vivo dans le modèle du poisson zèbre, dans le but de développer de nouveaux médicaments anti-inflammatoires applicables dans les maladies infectieuses et inflammatoires.

PUBLICATIONS

Paris T, Kiss A, Signor L, Lutfalla G, Blaise M, Boeri-Erba E, Chaloin L, Yatime L (2023) The IbeA protein from Adherent-Invasive Escherichia coli is a flavoprotein showing structural homology with FAD-dependent oxidoreductases. FEBS J. Online ahead of print. doi:10.1111/febs.16969

Leiba J, Ozbilgic R, Hernandez L, Demou M, Lutfalla G, #YatimeL, #NguyenChi M (2023) Molecular actors of inflammation and their signaling pathways : mechanistic insights from zebrafish. Biology 12, 153. doi : 10.3390/biology12020153 #Co-derniersauteurs

Paris T, Yatime L (2022) Les CEACAM épithéliales, plateformes d'ancrage des microorganismes pathogènes dans les muqueuses. Med Sci 38, 650-653. doi : 10.1051/medsci/2022097

Kowalewski J, Paris T, Gonzalez C, Lelièvre L, Castaño Valencia L, Boutrois M, Augier C, Lutfalla G, Yatime L (2021) Characterization of a member of the CEACAM protein family as a novel marker of proton pump-rich ionocytes on the zebrafish epidermis. PLoS ONE 16, e0254533. doi:10.1371/journal.pone.0254533

Signor L, Paris T, Mas C, Picard A, Lutfalla G, Bori-Erba E, Yatime L (2021) Divalent cations influence the dimerization mode of murine S100A9 protein by modulating its disulfide bond pattern. J Struct Biol 213:107689. doi:10.1016/j.jsb.2020.107689

May O, Yatime L, Merle NS, Delguste F, Howsam M, Daugan M, Constant CP, Billamboz M, Ghinet A, Lancel S, Dimitrov JD, Boulanger E, Roumenina LT, Frimat M (2020) The receptor for advanced glycation end products is a sensor for cell-free heme. FEBS J 288, 3448-3464. doi:10.1111/febs.15667

Yatime L (2019) Structural analysis of S100A8 complex with zinc and calcium : a general protocol for the study of S100 proteins in the presence of divalent cations by X-ray crystallography. In C. Heizmann (eds.), Calcium-Binding Proteins of the EF-Hand Superfamily (pp. 417-435). Methods in Molecular Biology, vol. 1929, Humana Press, New York, NY. doi:10.1007/978-1-4939-9030-6_26

Yatime L, Merle NS, Hansen AG, Friis NA, Østergaard JA, Bjerre M, Roumenina LT, Thiel S, Kristensen P, Andersen GR (2018) Un anticorps à domaine unique ciblant le composant C5 du complément agit comme un inhibiteur sélectif de la voie terminale du système du complément et imite ainsi fonctionnellement le domaine C-terminal de la protéine SSL7 de Staphylococcus aureus. Front Immunol 9:2822. doi:10.3389/fimmu.2018.02822

Yatime L (2017) Un mécanisme d'activation dépendant de la cystéine pour les ligands pro-inflammatoires de RAGE ? Med Sci 33, 351-354. doi:10.1051/medsci/20173303026

Yatime L, Betzer C, Jensen RK, Mortensen S, Jensen PH, Andersen GR (2016) The structure of the RAGE:S100A6 complex reveals a new mode of homodimerization for S100 proteins. Structure 24, 2043-2052. doi:10.1016/j.str.2016.09.011

Lin H, Andersen GR, Yatime L(2016) Crystal structure of human S100A8 in complex with zinc and calcium. BMC Struct Biol 16:8. doi:10.1186/s12900-016-0058-4

Yatime L, Bajic G, Schatz-Jakobsen JA, Andersen GR (2016) Complement regulators and inhibitors in health and disease : a structural perspective. Dans K.A. Howard, T. Vorup-Jensen et D. Peer (eds.), Nanomedicine (pp. 13-42). CRS Book Series Advances in Delivery Science and Technology, Springer-Verlag New York. doi:10.1007/978-1-4939-3634-2_2

Yatime L, Maasch C, Hoehlig K, Klussmann S, Andersen GR, Vater A (2015) Structural basis for the inhibition of complement anaphylatoxin C5a using a mixed L-RNA/L-DNA aptamer. Nat Commun 6:6481. doi:10.1038/ncomms7481

Laursen M, Gregersen JL, Yatime L, Nissen P, Fedosova NU (2015) Structures et caractérisation de la Na+,K+-ATPase liée à la digoxine et à la bufaline par rapport au complexe lié à l'ouabaïne. Proc Natl Acad Sci USA 112, 1755-1760. doi:10.1073/pnas.1422997112

Schatz-Jacobsen JA, Yatime L, Larsen C, Petersen SV, Klos A, Andersen GR (2014) Structural and functional characterization of human and murine C5a anaphylatoxins. Acta Cryst D70, 1704-1717. doi:10.1107/S139900471400844X

 

Yatime L, Andersen GR (2014) The specificity of DNA recognition by the RAGE receptor. J Exp Med 211, 749-750. doi:10.1084/jem.20132526

Yatime L, Andersen GR (2013) Structural insights into the oligomerization mode of the human Receptor for Advanced Glycation End-products (RAGE). FEBS J 280, 6556-6568. doi:10.1111/febs.12556

Bajic G, Yatime L, Sim RB, Vorup-Jensen T, Andersen GR (2013) Structural insight on the recognition of surface-bound opsonins by the integrin I-domain of complement receptor 3. Proc Natl Acad Sci USA 110, 16426-16431. doi:10.1073/pnas.1311261110

Laursen M, Yatime L, Nissen P, Fedosova NU (2013) Crystal structure of the high-affinity Na+,K+-ATPase - ouabain complex with Mg2+ bound in the cation binding site. Proc Natl Acad Sci USA 110, 10958-10963. doi:10.1073/pnas.1222308110

Bajic G, Yatime L, Klos A, Andersen GR (2013) Human C3a and C3a desArg anaphylatoxins have conserved structures, in contrast to C5a and C5a desArg. Protein Sci 22, 204-212. doi:10.1002/pro.2200

Kidmose RT, Laursen NS, Dobó J, Kjaer TR, Sirotkina S, Yatime L, Sottrup-Jensen L, Thiel S, Gál P, Andersen GR (2012) Structural basis for activation of the complement system by component C4 cleavage. Proc Natl Acad Sci USA 109, 15425-15430. doi:10.1073/pnas.1208031109

Yatime L, Hein KL, Nilsson J, Nissen P (2011) Structure of the RACK1 dimer from Saccharomyces cerevisiae. J Mol Biol 411, 486-498. doi:10.1016/j.jmb.2011.06.017

Gourdon P, Andersen JL, Hein KL, Bublitz M, Pedersen BP, Liu XY, Yatime L, Nyblom M, Nielsen TT, Olesen C, Møller JV, Nissen P, Morth JP (2011) HiLiDe - Systematic Approach to Membrane Protein Crystallization in Lipid and Detergent. Crystal Growth & Design 11, 2098-2106. doi:10.1021/cg101360d

Yatime L, Laursen M, Morth JP, Esmann M, Nissen P, Fedosova NU (2011) Structural insights into the high affinity binding of cardiotonic steroids to the Na,K-ATPase. J Struct Biol 174, 296-306. doi:10.1016/j.jsb.2010.12.004

Yatime L, Buch-Pedersen MJ, Musgaard M, Morth JP, Lund Winther AM, Pedersen BP, Olesen C, Andersen JP, Vilsen B, Schiøtt B, Palmgren MG, Møller JV, Nissen P, Fedosova N (2009) P-type ATPases as drug targets : tools for medicine and science. Biochim Biophys Acta 1787, 207-220. Review. doi:10.1016/j.bbabio.2008.12.019

Yatime L, Mechulam Y, Blanquet S, Schmitt E (2007) Structure of an archaeal heterotrimeric initiation factor 2 reveals a nucleotide state between the GTP and the GDP states. Proc Natl Acad Sci USA 104, 18445-18450. doi:10.1073/pnas.0706784104

Mechulam Y, Guillon L, Yatime L, Blanquet S, Schmitt E (2007) Protection-based assays to measure aminoacyl-tRNA binding to translation initiation factors. Methods Enzymol 430, 265-281. doi:10.1016/S0076-6879(07)30011-6

Yatime L, Mechulam Y, Blanquet S, Schmitt E (2006) Structural switch of the g subunit in an archaeal aIF2ag heterodimer. Structure 14, 119-128. doi:10.1016/j.str.2005.09.020

Yatime L, Schmitt E, Blanquet S, Mechulam Y (2005) Structure-function relationships of the intact aIF2a subunit from the archaeon Pyrococcus abyssi. Biochemistry 44, 8749-8756. doi:10.1021/bi050373i

Yatime L, Schmitt E, Blanquet S, Mechulam Y (2004) Functional molecular mapping of archaeal translation initiation factor 2. J Biol Chem 279, 15984-15993. doi:10.1074/jbc.M311561200