Laboratoire des pathogènes et de l'immunité de l'hôte

Mini-bio - Ana Rita Gomes

GOMES Ana Rita

POSITION

Chercheur au CNRS (CRCN), PhD, HDR

Équipe "Approchesmoléculairespour de nouvelles stratégies antipaludiques" 

Groupe "Le paysage génétique de la réplication de l'ADN chez P. falciparum"

CONTACT

E-mail : ana-rita.batista-gomes[at]umontpellier.fr

Téléphone : +33 (0)4 67 14 36 87 +33 (0)4 67 14 36 87

BIOGRAPHIE

Microbiologiste de formation, je me suis inscrit au programme de doctorat du Wellcome Sanger Institute, à Cambridge (Royaume-Uni), pour étudier la génétique fonctionnelle du paludisme en 2010. Au cours de cette période, j'ai mis au point une technologie (barseq) qui a ouvert la recherche sur le paludisme au criblage génétique inverse à grande échelle. En tant que post-doctorant, nous avons poursuivi le développement de cette technologie et réalisé le premier crible d'essentialité à l'échelle du génome dans un parasite du paludisme. Nous avons montré que les parasites du paludisme ont la plus grande proportion de gènes essentiels jamais rapportée - probablement une conséquence des réductions génomiques au cours de l'évolution du parasitisme. Pendant mon séjour au Sanger, j'ai également participé au développement de la transcriptomique des cellules uniques de Plasmodium. Ensuite, en 2016, j'ai rejoint le LSHTM à Londres, et j'ai mené un projet de surveillance épidémiologique génomique pour évaluer la prévalence des virus Zika et de la dengue, dans l'archipel du Cap-Vert.

J'ai été recrutée par le CNRS en tant que CRCN en décembre 2018, et j'ai rejoint le LPHI, à Montpellier. 

Mon groupe est actuellement financé par la subvention de démarrage ANR JCJC (2020-2024) et i-SITE MUSE (2021-2023). Notre objectif est d'explorer la réplication de l'ADN et la régulation du cycle cellulaire chez les parasites du paludisme. 

PUBLICATIONS

Ukegbu CV, Gomes AR, Giorgalli M, Campos M, Bailey AJ, Besson TRB, Billker O, Vlachou D, Christophides GK (2023) Identification of genes required for Plasmodium gametocyte-to-sporozoite development in the mosquito vector. Cell Host Microbe 31:1539-1551.e6. doi:10.1016/j.chom.2023.08.010

Gomes AR, Marin-Menendez A, Adjalley S, Bardy C, Cassan C, Lee M, et al (2022) A transcriptional switch controls sex determination in Plasmodium falciparum. Nature 612:528-533. doi:10.1038/s41586-022-05509-z

Ward D, Gomes AR, Tetteh K, Sepulveda N, Gomez LF, Campino S, Clark TG (2022) Sero-epidemiological study of arbovirus infection following the 2015-2016 Zika virus outbreak in Cabo Verde. Sci Rep 12:11719. doi:10.1038/s41598-022-16115-4

Gurung P, Gomes AR, Martins RM, Juranek SA, Alberti P, Mbang-Benet D, et al(2021) PfGBP2 is a novel G-quadruplex binding protein in Plasmodium falciparum. Cell Microbiol 23:e13303. doi:10.1111/cmi.13303

Campos M, Ward D, Morales RF, Gomes AR, Silva K, Sepúlveda N, et al (2020) Surveillance des populations d'Aedes aegypti dans la ville de Praia, Cap-Vert : Infection par le virus Zika, résistance aux insecticides et diversité génétique. Parasit Vectors 13:481. doi:10.1186/s13071-020-04356-z

Gazanion E, Lacroix L, Alberti P, Gurung P, Wein S, Mergny JL, Gomes AR* et Lopez-Rubio JJ* (2020) Genome wide distribution of G-quadruplexes and their impact on gene expression in malaria parasites. PLoS Genet 16:e1008917. doi:10.1371/journal.pgen.1008917. *Coauteur principal

Benavente ED, Gomes AR, Silva JR, Grigg MJ, Walker H, Barber B, William T, Yeo TW, Sessions PF, Ramaprasad A, Ibrahim A, Charleston J, ..., Campino SG, Clark T (2019) Whole genome sequencing of amplified Plasmodium knowlesi DNA from unprocessed blood reveals genomic exchange events between Malaysian Peninsular and Borneo subpopulations. Sci Rep 9(1):9873. doi:10.1038/s41598-019-46398-z

He Y, Campino SG, Benavente ED, Warhurst D, Beshir K, Lubis I, Gomes AR, Feng J, Jiazhi W, Sun X, Huang F, Tang L, Sutherland C, Clark T (2019) Artemisinin resistance-associated markers in Plasmodium falciparum parasites from the China-Myanmar border : predicted structural stability of K13 propeller variants detected in a low-prevalence area. PLoS One 14:e0213686 . doi:10.1371/journal.pone.0213686

Fang H*, Gomes AR*, Klages N*, Pino P, Maco B, Walker EM, Zenonos Z, Angrisano F, Baum J, Doerig C, Baker D, Billker O, Brochet M (2018) Epistasis studies reveal redundancy among calcium-dependent protein kinases in motility and invasion of malaria parasites. Nat Commun 9:4248. doi:10.1038/s41467-018-06733-w. *Co-premier auteur

Reid AJ*, Talman AM*, Bennett HM*, Gomes AR, Sanders MJ, Illingworth CJR, Billker O, Berriman M, Lawniczak MKN (2018) Single-cell RNA-seq reveals hidden transcriptional variation in malaria parasites. eLife 7:e33105. doi:10.7554/eLife.33105

Gomes AR, Ravenhall M, Benavente ED, Talman A, Sutherland C, Roper C, Clark TG, Campino S (2017) Genetic diversity of next generation antimalarial targets : Une base de référence pour les programmes de surveillance de la résistance aux médicaments. Int J Parasitol Drugs Drug Resist 7:174-180. doi:10.1016/j.ijpddr.2017.03.001

Mancio-Silva L, Slavic K, Grilo Ruivo MT, Grosso AR, Modrzynska KK, Vera IM, Sales-Dias J, Gomes AR, MacPherson CR, Crozet P, Adamo M, Baena-Gonzalez E, Tewari R, Llinás M, Billker O, Mota MM (2017) Nutrient sensing modulates malaria parasite virulence. Nature 547:213-216. doi:10.1038/nature2300

Modrzynska K, Pfander C, Chappell L, Yu L, Suarez C, Dundas K, Gomes AR, Goulding D, Rayner JC, Choudhary J, Billker O (2017) A Knockout Screen of ApiAP2 Genes Reveals Networks of Interacting Transcriptional Regulators Controlling the Plasmodium Life Cycle. Cell Host Microbe 21:11-22. doi:10.1016/j.chom.2016.12.003

Dombrowski JG, Souza RM, Curry J, Hinton L, Silva NRM, Grignard L, Gonçalves LA, Gomes AR, Epiphanio S, Drakeley C, Huggett J, Clark TG, Campino S, Marinho CRF (2017) Allèles de déficit en G6PD dans une région endémique du paludisme dans l'ouest de l'Amazonie brésilienne. Malar J 16:253. doi:10.1186/s12936-017-1889-6

Bushell E*, Gomes AR*, Sanderson T*, Anar B, Girling G, Herd C, Metcalf T, Modrzynska K, Schwach F, Martin RE, Mather MW, McFadden GI, Parts L, Rutledge GG, Vaidya AB, Wengelnik K, Rayner JC, Billker O (2017) Functional Profiling of a Plasmodium Genome Reveals an Abundance of Essential Genes. Cell 170, 260-272 e268. doi:10.1016/j.cell.2017.06.030. *Co-premier auteur

Gomes AR, Talman AM (2016) Commitment issues in Plasmodium. Nat Rev Microbiol 14(1):4. doi:10.1038/nrmicro.2015.9

Gomes AR, Bushell E, Schwach F, Girling G, Anar B, Quail MA, Herd C, Pfander C, Modrzynska K, Rayner JC, Billker O (2015) A genome-scale vector resource enables high-throughput reverse genetic screening in a malaria parasite. Cell Host Microbe 17:404-13. doi:10.1016/j.chom.2015.01.014

Schwach F*, Bushell E*, Gomes AR, Anar B, Girling G, Herd C, Rayner JC, Billker O (2015) PlasmoGEM, a database supporting a community resource for large-scale experimental genetics in malaria parasites. Nucleic Acids Res 43 : D1176-82. doi:10.1093/nar/gku1143

Brochet M, Collins MO, Smith TK, Thompson E, Sebastian S, Volkmann K, Schwach F, Chappell L, Gomes AR, Berriman M, Rayner JC, Baker DA, Choudhary J, Billker O (2014) Phosphoinositide metabolism links cGMP-dependent protein kinase G to essential Ca²⁺ signals at key decision points in the life cycle of malaria parasites. PLoS Biol 12:e1001806. doi:10.1371/journal.pbio.1001806

Suarez C, Volkmann K, Gomes AR, Billker O, Blackman MJ (2013) The malarial serine protease SUB1 plays an essential role in parasite liver stage development. PLoS Pathog 9:e1003811. doi:10.1371/journal.ppat.1003811

Gomes-Santos CS, Braks J, Prudêncio M, Carret C, Gomes AR, Pain A, Feltwell T, Khan S, Waters A, Janse C, Mair GR, Mota MM (2011) La transition des sporozoïtes de Plasmodium vers des formes semblables à celles du foie est régulée par la protéine de liaison à l'ARN Pumilio. PLoS Pathog 7:e1002046. doi:10.1371/journal.ppat.1002046