Approches génomiques du paludisme chronique asymptomatique
Chef d'équipe
Dr. Antoine Claessens
Intérêts de la recherche
Comment Plasmodium falciparum maintient-il des infections chroniques et asymptomatiques ?
L'équipe GATAC-Malaria s'attaque à cette question fondamentale en s'appuyant sur des technologies "omiques" de pointe et sur des échantillons de sang collectés sur le terrain.
Le réservoir caché : Un défi et une opportunité
Les infections asymptomatiques à Plasmodium falciparum constituent un obstacle majeur aux efforts d'élimination du paludisme. Ces porteurs silencieux ne se contentent pas de maintenir la transmission, ils offrent également une fenêtre unique sur l'interaction à long terme entre l'hôte et le parasite.
Nos recherches visent à comprendre comment P. falciparum survit et se développe pendant les six mois de la saison sèche, lorsque la transmission par les moustiques est minimale. En étudiant des échantillons de sang d'individus asymptomatiques en Gambie, au Cameroun et au Ghana, nous cherchons à découvrir les stratégies moléculaires qui permettent au parasite de persister chez les hôtes humains.
Notre approche : Relier le travail sur le terrain aux connaissances moléculaires
Nous utilisons des techniques avancées de transcriptomique et de génomique, notamment :
- Séquençage PacBio long-read
- Séquençage de l'ADN d'une seule cellule
- ARNseq en vrac
Nous nous concentrons principalement sur les schémas de transcription des gènes var, qui sont à l'origine de la variation antigénique, un mécanisme clé qui permet au parasite d'échapper au système immunitaire. Contrairement aux études précédentes qui s'appuient sur des modèles in vitro de la souche 3D7 adaptée au laboratoire, nous étudions ces processus directement dans les isolats de terrain. Cela nous permet de tester et d'affiner les hypothèses sur l'expression des gènes var qui s'excluent mutuellement dans des environnements réels.
Pourquoi c'est important
En révélant comment P. falciparum établit et maintient des infections asymptomatiques, nous visons à identifier les moteurs moléculaires critiques de la chronicité. Ces connaissances sont essentielles pour développer de nouvelles stratégies visant à perturber le réservoir infectieux caché et à faire progresser les efforts d'éradication du paludisme.
Faits marquants récents
Nous avons récemment publié nos principaux objectifs dans Trends in Parasitology, voici un résumé vidéo de 2 minutes.
Nos collaborations et financements
Notre équipe FRM fait partie de ParaFrap, un consortium de parasitologues moléculaires français, et de MalariaGEN, un consortium pour la génomique du paludisme. Nous sommes actuellement financés par FRM, ANR et Muse.
RECRUTEMENT: N'hésitez pas à nous contacter si vous souhaitez rejoindre notre équipe dynamique en tant que Master / PhD /Post-doc.