Approches génomiques du paludisme chronique asymptomatique
Chef d'équipe
Dr. Antoine Claessens
Intérêts de la recherche
Comment le parasite du paludisme Plasmodium falciparum peut-il établir une infection chronique et asymptomatique chez un hôte humain ? L'équipe GATAC-Malaria répond à cette question en utilisant des isolats sanguins collectés sur le terrain et la technologie du séquençage de nouvelle génération.
Notre équipe ATIP-Avenir fait partie de ParaFrap, un consortium de parasitologues moléculaires français, et de MalariaGEN, un consortium pour la génomique du paludisme. Nous sommes actuellement financés par une bourse ANR-JCJC attribuée à Antoine Claessens.
Les infections asymptomatiques de Plasmodium falciparum , le réservoir infectieux caché, constituent un défi majeur pour toute campagne d'élimination du paludisme. Néanmoins, ces infections peuvent fournir des informations utiles sur les interactions entre l'hôte et le pathogène sur une longue période de temps. Notre laboratoire s'efforce de comprendre comment les parasites P. falciparum peuvent survivre dans les infections chroniques humaines pendant les six mois de la saison sèche, en utilisant des échantillons de sang provenant d'une cohorte de volontaires asymptomatiques en Gambie. Pour explorer comment le parasite détecte son environnement et s'y adapte, nous mesurons le taux de multiplication du parasite et séquençons son transcriptome. Notre nouveau protocole permet de séquencer un transcriptome entier à partir de 1000 parasites seulement. Nous identifierons les gènes associés à la saisonnalité en utilisant des échantillons de la saison sèche et de la saison humide en Gambie. Parallèlement, nous nous concentrons sur la variation antigénique du parasite en analysant la dynamique du schéma de transcription du gène var.
En résumé, nous ferons progresser notre compréhension de la biologie du parasite et découvrirons les principaux moteurs moléculaires des infections asymptomatiques, une étape essentielle pour permettre l'éradication du paludisme.
Nous avons récemment publié nos principaux objectifs dans Trends in Parasitology, voici un résumé vidéo de 2 minutes.